Buildがあわない

先週（あれ、先々週だった？）MAQでAssembleしたシークエンスデータ、リファレンスのNCBI buildが37だったこれをHapMapのGenotypeデータと比較しようと思ったところ、HapMapのrelease 27はNCBI build 36をつかっているとのこと失敗した・・・AssembleをBuild…

2010-04-23

Maqの使い方まとめ

自分用まとめです下調べ GCOEテクニカルセミナーのレジメがすごく役立った(ここ) S.pombe分裂中さんの記事もわかりやすかったです(ここ) 参考にさせていただきましたありがとうございますレファレンスのシークエンスをとってくる Humanのレファレンス配列…

2010-04-14

BioPerlをインストール

1. CPANをアップデート $sudo perl -MCPAN -e shell install Bundle::CPAN 2. Module::Buileのアップデート $sudo perl -MCPAN -e shell install Module::Build それからModule::Buildをインストーラーに指定する o conf prefer_installer MB o conf commit …

2010-04-10

MacPortのインストール

ウチの職場ではrsyncが通らないので、svnでアップデートできるようにする１．svnがproxyを経由するように下準備 ~/.subversion/servers を編集する(sudoで) [global]# http-proxy-exceptions = *.exception.com, www.internal-site.org # http-proxy-host =…